Na terenie Gminy Gościno występują dwa obszary Natura 2000.
SOO Dorzecze Parsęty PLH320007
Rozległa ostoja znajdująca się w granicach administracyjnych 20 miast i gmin województwa zachodniopomorskiego koncentrujących się w dolinie rzeki Parsęty i jej dopływach. W gminie Gościno zlokalizowana jest w jej centralnej części i obejmuje dolinę Parsęty i jej dopływy – Młynówkę
i Pokrzywnicę. Są to zarówno bagienne obszary łąk i szuwarów zajmujące dno dolin rzecznych,
a także kompleksy leśne buczyn, grądów, łęgów, dąbrów i sosnowych lasów gospodarczych występujących na ich krawędziach. Powierzchnia ostoi wynosi 27 710,43 ha (ponad 3000 ha na terenie Gminy).
Dorzecze Parsęty to bardzo dobrze zachowane biotopy dla ptaków drapieżnych: orlika krzykliwego, błotniaka stawowego, kani rudej, bielika, puchacza, sowy błotnej oraz dla ptaków związanych
z obszarami wodno-błotnymi: bociana białego i czarnego, zimorodka, żurawia, sieweczki rzecznej, kulika wielkiego. Parsęta to równie ważne miejsce dla zimowania ptaków wodno-błotnych oraz naturalny obszar rozrodu wydry i bobra. Parsęta w porównaniu z innymi polskimi rzekami posiada najlepsze warunki tarła ryb łososiowatych: łososi i troci oraz pstrąga potokowego i lipienia, tj. czyste, zimne wody o charakterze górskim. Do pozostałych zwierząt zasiedlających wody Parsęty.
Część obszaru pozostająca w granicach gminy Gościno jest bardzo cenna pod względem faunistycznym. Z przedmiotów ochrony nie została stwierdzona jedynie pachnica dębowa. Występują za to wykazywane dla całego obszaru zarówno najcenniejsze gatunki ryb, jak i liczna populacja płazów z kumakiem nizinnym i traszką grzebieniastą na czele. Bogactwem cechuje się również teriofauna włączenie z chronionymi gatunkami średnich ssaków – bobrem i wydrą jak, i micromamalia z rzęsorkiem rzeczkiem, ryjówką malutką, ryjówką aksamitną czy badylarką. Liczna jest też entomofauna z obecnym przedmiotem ochrony – trzeplą zieloną.
SOO Kemy Rymańskie PLH320012
Ostoja zlokalizowana jest w południowo – zachodniej części gminy Gościno. Są to jej wschodnie rubieże cechujące się silnie zróżnicowaną rzeźbą terenu, porośnięte głównie buczynami, łęgami
i olsami źródliskowymi. Większa część obszaru Natura 2000 znajduje się w sąsiedniej gminie Rymań
i Siemyśl. Są to wzgórza kemowe pokryte lasami, głównie liściastymi oraz użytkowane jako grunty rolne. Powierzchnia ostoi wynosi 2644,84 ha (ok. 286 ha na terenie Gminy).
Obszar cechuje się dużym zróżnicowaniem siedlisk (15 typów z załącznika I Dyrektywy Siedliskowej)
i szatą roślinną o wysokim stopniu naturalności. Udział siedlisk przyrodniczych szacowany jest na 68% powierzchni ostoi. Tak duże zróżnicowanie i pokrycie siedlisk przyrodniczych wiąże się z trudnym
w użytkowaniu terenem wysoczyzny morenowej. Wzgórza kemowe osiągają ok. 40-50 m n.p.m. Rozpościerają się one pomiędzy dolinami rzek Mołstowej, Dębosznicy i Błotnicy. Zasiedlają je dobrze zachowane kwaśne dąbrowy, grądy subatlantyckie, kwaśne i żyzne buczyny. W obniżeniach dogodne warunki rozwojowe znajdują siedliska bagienne z borami i brzezinami bagiennymi, torfowiskami przejściowymi i wysokimi, zasadowymi, a także łęgi jesionowo-olszowe i olsy źródliskowe. Rynny
i zagłębienia terenu wypełniają jeziora eutroficzne (jezioro Kamienica) i drobne zbiorniki dystroficzne. Różnorodność siedlisk uzupełniają łąki świeże, ziołorośla nadrzeczne i śródlądowe murawy napiaskowe rozproszone na całym obszarze ostoi. Wśród gatunków fauny obserwowane były: traszka grzebieniasta, kumak nizinny (załącznik II Dyrektywy Siedliskowej), orlik krzykliwy, kania ruda (załącznik I Dyrektywy Ptasiej). W niewielkiej części całego obszar, jaki znajduje się na terenie Gminy, z gatunków dyrektywowych odnaleziono jedynie bobra i wydrę. Mimo to występuje tam wiele zwierząt chronionych polskim prawem, szczególnie pospolitych płazów.